Не обязательно "проблема/особенность/баг ломаной".
В лицензионной 5.45 тоже случаются ошибки математики. Допустим, помещаешь полку внутрь корпуса, упираешь влево и растягиваешь вправо до упора, а она пролетает в пересечение. Тогда делаю наоборот, упираю вправо и растягиваю влево - нормально упирается. Еще заметил, что такое случается если в габаритах по неким причинам возникли десятые, которых Pro100 в своем пространстве не понимает. К примеру, вытягивается по высоте группа - стопка полок и нулевые объекты между ними (для равномерности), если математически не получается круглых промежутков, может не упираясь пролететь сквозь.
И в лицензии хватает косячков